国务院总理李克强9月29日主持召开国务院常务会议，确定加强进口的政策措施，促进扩大对外开放；决定实施煤炭资源税改革，推进清费立税、减轻企业负担；部署强化审计工作，推动政策措施落实、服务经济社会发展。
会议认为，煤炭资源税改革是深化财税体制改革的重要内容和既定任务。目前我国原油、天然气资源税改革已全面实施，实行煤炭资源税改革，完善资源产品价格形成机制，既能让资源地区受益，推进区域协调发展，通过减少名目繁多的收费，增强企业发展后劲，也可促进煤炭资源合理开采利用，推动科学发展。会议决定，在做好清费工作的基础上，从今年12月1日起，在全国将煤炭资源税由从量计征改为从价计征，税率由省级政府在规定幅度内确定。会议要求，要立即着手清理涉煤收费基金，停止征收煤炭价格调节基金，取消原生矿产品生态补偿费、煤炭资源地方经济发展费等，取缔省以下地方政府违规设立的涉煤收费基金，严肃查处违规收费行为，确保不增加煤炭企业总体负担。
李克强说，在原油、天然气资源税改革全面实施后，当前宏观经济运行平稳，煤炭价格低位运行，总体来看，是推出煤炭资源税改革的较好时机。
据《经济参考报》记者了解，相对于油气资源，煤炭资源税“从价计征”的改革更为复杂。因此，煤炭资源税改革并未随油气资源税改革同时推出。2012年以来，随着市场供需形势快速变化和价格下跌，煤炭资源税改革时机相对成熟，从十八届三中全会、中央经济工作会议到财政部以及国税总局均明确将其列为2014年的重点工作之一，山西、陕西等产煤大省也都积极上报改革方案。
但是，在煤炭价格走低、煤企日子本已不堪的情况下，煤炭企业税费负担沉重的问题更加凸显，煤炭资源税改为“从价计征”则不可避免要提高税负水平。中国煤炭工业协会的报告显示，由于增值税进项税抵扣范围较少，煤炭企业增值税实际税负在11%以上，远高于其他工业行业税负水平。此外，煤炭税费重复征收、不合理收费项目多等问题未得到根本解决，各种涉煤税费已占企业营业收入的25%至35%，其中大部分项目主要是地方各级政府和社会组织设置。
据中国煤炭工业协会副会长姜智敏介绍，煤炭资源税改革方案中划定的税率区间在2%到10%。这意味着，煤炭企业若按当前环渤海动力煤价每吨482元销售，需缴纳资源税9.6元至48.2元，将比目前最高每吨5元的税负上升近2倍至10倍。
据中国政府网消息，常务会议上，一位参会领导提出，税费改革的过程中，如果不先“清费”，担心加重煤炭企业负担，李克强点头予以肯定。他说，清费立税后煤炭企业的总体负担不能增加，这是此次改革的前提，要明确写入文件中。各省在推进这一改革过程中必须把握一个关键点：改革绝不能让企业增负，而要为税费比例逐步合理奠定基础。
在会议接近尾声时，李克强重新回到这一话题上：“我实在担心，在‘清费立税’过程中，‘费’还没清完，‘税’就已经立好了，让企业的运行雪上加霜。”对此，财政部负责人立刻回应，改革中可以明确一个要求：费没有清完的地区，坚决不允许新设征税项目。
李克强不增企业总体负担的表态让业界吃下了定心丸。“如果真能取消煤炭价格调节基金，资源税改为计价征税，冲击不会太大，关键看各省的细则和幅度。”智诚达能源咨询公司总经理马俊华说。
另有煤炭企业人士表示，煤炭黄金十年开征的一系列费用着实已经不适应现在的形势，逐步取消对煤企应属利好，还有一些保证金性质的收费，只见收取不见返还，如今也应该逐步落实。不过，取消不当收费只能算是短期刺激政策，长期还需煤企挖潜增效，自增活力。
据了解，继今年1月1日起，取缔除中央和省定项目以外的一切违规收费，对煤炭可持续发展基金各煤种征收标准降低3元/吨之后，山西省7月对涉煤收费再次全面梳理，正式出台目录清单。陕西、四川也在今年年中纷纷公布“涉煤收费清单”，展开煤炭业清费大行动。
据山西省财政厅测算，在全面取缔涉煤收费，包括取消煤炭可持续发展基金的前提下要保证地方现有收益，以煤炭平均售价465元/吨计算，资源税率可定为7.4%；如果煤价进一步下跌至440元/吨，只需修改为7.6%即可。假如保留煤炭可持续发展基金，资源税率可进一步降为2%和2.2%。
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